上海公司的注册资金变更流程如下：
1. 准备材料：申请变更的公司章程、企业法人营业执照副本复印件、事业单位法人证书副本复印件、法定代表人身份证复印件等。
2. 填写申请表：根据上海市工商行政管理局的要求，填写《工商业注册登记变更申请书》。
3. 出资方式变更：如果变更是涉及出资方式的变更，需提供有关证明材料，如营业执照等。
4. 资金变更注册：将填写完成的申请表及相关材料提交给上海市工商行政管理局，进行资金变更的注册手续。
5. 审核及审批：上海市工商行政管理局会对提交的材料进行审核，并进行资金变更的审批。
6. 领取证件：资金变更审批通过后，可以到上海市工商行政管理局领取新的营业执照，证明资金变更已成功完成。
需要注意的是，具体的注册资金变更流程可能会受到相关政策法规的影响，建议在进行注册资金变更前先了解最新的上海市工商行政管理局的规定，并咨询相关专业人士的意见。